У своїй діяльності музей керується рішеннями та рекомендаціями Наглядової ради, Науково-методичної ради, Експертної ради й Опікунської ради.
Упродовж 2017 року основну активність у напрацюванні шляхів розбудови музею виявив Організаційний комітет з питань розвитку Національного меморіального комплексу Героїв Небесної Сотні – Музею Революції Гідності.
У травні того ж року комітет ухвалив Концепцію Національного меморіального комплексу Героїв Небесної Сотні – Музею Революції Гідності (PDF). Над її кінцевим виглядом працювала експертна робоча група в такому складі:
- Бакланова Олександра – консультант зі стратегії та управління змінами, співзасновниця Несторівської та Унівської міждисциплінарних експертних груп;
- Бондар Ганна – заступник директора Департаменту містобудування та архітектури Київської міської державної адміністрації;
- Бобровський Тимур – археолог, пам’яткоохоронець, член ініціативної групи "Музей Майдану / Музей Свободи";
- Бондарчук Володимир – голова ГО "Родина Героїв "Небесної Сотні";
- ван Ворен Роберт – голова ГО "Фонд збереження історії Майдану";
- В’ятрович Володимир – голова Українського інституту національної пам’яті;
- Гайдукевич Анастасія – начальник відділу музейної справи Управління інституційного забезпечення політики національної пам’яті Українського інституту національної пам’яті, секретар експертної робочої групи;
- Гурик Ігор – голова правління БФ "Майдан Гідності";
- Ґуріан Елейн – музейний експерт, ексзаступник директора Меморіального музею Голокосту та Національного музею американських індіанців у Вашингтоні, ексзаступник Секретаря Смітсонівського інституту (США);
- Дяченко Сергій – музейний фахівець, краєзнавець, архітектор, експерт низки проєктів ЄС у сфері музейної справи та культури;
- Зінченко Олександр – історик, публіцист, співзасновник сайту "Історична правда", автор та ведучий проєкту "Розсекречена історія" ("UA:Перший"), член ініціативної групи "Музей Майдану / Музей Свободи";
- Мазурик Зеновій – музейний експерт, віцепрезидент ІКОМ України;
- Мельник Ольга – керівник відділу музейної справи НКММК "Мистецький Арсенал";
- Мусієнко Наталя – провідний науковий співробітник Інституту проблем сучасного мистецтва Національної академії мистецтв України;
- Нахманович Віталій – провідний науковий співробітник Музею історії міста Києва, відповідальний секретар Громадського комітету для вшанування пам’яті жертв Бабиного Яру;
- Норріс Лінда – музейний експерт, директор програм глобальних мереж Міжнародної коаліції місць сумління (США);
- Осьмак Владислава – культуролог, член Ради громадських експертів конкурсу "Територія Гідності";
- Піоро Владислав – музейний експерт, голова правління ГО "Український центр розвитку музейної справи";
- Пошивайло Ігор – генеральний директор Національного меморіального комплексу Героїв Небесної Сотні – Музею Революції Гідності, голова правління ГО "Музей Майдану", член Комітету ІКОМ зі збереження культурної спадщини в надзвичайних умовах, голова експертної робочої групи;
- Рожко Василь – член правління ГО "Музей Майдану", член ініціативної групи "Музей Майдану / Музей Свободи";
- Романова Катерина – старший науковий співробітник Музею історії міста Києва, член ініціативної групи "Музей Майдану / Музей Свободи";
- Скиба Микола – директор ГО "Агенція культурних стратегій", експерт напряму "Освіта" Українського інституту майбутнього;
- Чуєва Катерина – заступник генерального директора Національного музею мистецтв імені Богдана і Варвари Ханенків, член Комітету ІКОМ меморіальних музеїв пам’яті жертв злочинів ICMEMO.